수목원의 중심 습지로서 다양한 수생식물의 종류와 생태적 특성을 이해할 수 있는 공간
자생식물인 백리향, 꽃향유, 고본 등의 방향성 식물의 향기를 체험할 수 있는 공간
강희안의 저서인 양화소록에 소개된 식물과 괴석을 전시한 정원
왜성침엽수의 다양한 수형, 질감, 색감 등을 느낄 수 있는 침엽수 정원
전통 항아리 및 도자기에 수행식물, 분재 등을 자연환경에 어우러지도록 조성한 정원
화강석을 나이테 모양으로 조성하여 여주의 오랜 역사와 문화자원을 시대별로 소개한 휴게 공간
남한강의 수석, 습지식물 그리고 멸종위기식물인 단양쑥부쟁이 군락을 복원한 전시 정원
다양한 열매식물을 식재하여 열매의 형태와 이용에 대하여 학습할 수 있는 정원
주변에서 보기 힘든 고산지역 또는 암석지대의 식물을 전시하고 보전하기 위한 정원
서양측백나무를 기하학적 모양으로 식재하여 호기심과 흥미를 느낄 수 있는 놀이공간
벼과 · 사초과식물 전문 수집원 및 약용식물의 종류와 효능을 학습할 수 있는 테마공원
황학산수목원 조성 과정에서 발굴, 이전 복원된 통일신라시대의 매장유물로서 삼국시대의 세력변화를 연구하는데 중요한 학술적 가치를 지닌 문화재